融资融券账户可以进行打新操作，但是其交易的个股是a股市场上的股票，而新三板并不属于a股市场上的个股，因此融资融券账户不可以参于打新三板的股票。
同时，新三板打新存在以下的交易规则：
1、申购条件
前10个交易日证券账户及资金账户内的资产日均不低于100万元，且并具有2年以上证券、基金、期货投资经历，开通新三板创新权限，精选层已改革为北交所，个人投资者准入门槛为开通交易权限前20个交易日日均证券资产50万元。
2、申购时间
交易日的：9：15－11：30，13：00－15：00。
3、申购数量
申购数量应当为100股或其整数倍，且不得超过9999.99万股。
4、市值要求
没有底仓市值要求，但需要全额预缴申购资金。
需要注意的是，竞价方式下报价作为最高报价部分被剔除或报价低于发行价被定为无效报价，打新资金需冻结2天，资金不足或将影响6个月内的精选层打新，网下打新若违规将精选层和A股各板块合并计算。
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