1、花费时间更多
虽然做超短交易的持有时间很短，但是其交易比较频繁，所以就相当于不停地在选择新的股票投资，还有看盘。超短交易就需要花费大量的时间和精力去挑选股票，并且市场是时刻变动的，价格也是。
再一个看盘时间过长的话，容易早场身体疲惫，过度紧张，交易日每天交易好几个小时，期间超短的投资者都一直是精神高度紧绷状态，盘口的变化也会影响投资者的判断和心情。所以大部分投资者觉得做超短交易比较考验投资者的身体素质，很难接受。
2、冲动交易
因为超短交易的变化较快，包括技术面，消息面的不断变化会影响投资者的判断，有些投资者就容易被带偏，冲动交易。
3、交易手续费高
超短的交易特别频繁，虽然每次的费用并没有多少，但是常年累计的话也是一笔较大的费用，主要是包括印花税和各种交易费用。
4、全面注册制的实行使得超短比以前更难操纵，具体体现在下面这些方面：
（1）涨跌幅限制
注册制实行后涨停打板不能让高于涨幅2%的挂单，否则被认为挂的单为废单，这样就会直接导致超短线交易接力空间急剧减少。
（2）个股波动增大
注册制之后，沪市主板、科创板还有创业板个股在上市后前五个交易日是没有涨跌幅限制的，所以会导致其波动性增大、不确定性加大，增加了其风险性。一旦散户判断错误，将会导致损失惨重。
（3）个股上市门槛降低
实行注册制后，规定企业的上市门槛降低，也就是说上市公司的质量相比于之前来说会更差，散户保障降低，特别是对于那些专业知识缺乏，容易跟风的散户投资者来说，获利的难度大大增加，导致投资者亏损的因素增多。
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