1、含义不同
两者都是是投资者交易成本的重要组成部分，也是交易所的主要收入来源之一。证券经手费是指在证券交易所的场内交易之后，按照实际成交额计算的一定比例向证券交易所缴纳的交易费用。证券经手费一般是由证券公司直接向客户收取。
印花税是指在某些特定的交易或行为中，按照法定比率征收的一种税费，主要用于保证合同和文件的合法性和有效性，以及维护国家的财政收入，股票印花税主要是由国家征收，由券商代扣之后再统一上交。
2、征收部门不同
证券经手费主要是由证券公司收取的，并且是直接向证券公司收取的，证券公司一般与投资者是有合同关系的，并且由证监会进行监管。
印花税主要是由国家征收的，征收主体是国家的财政部门，由国家税务机关负责征收，具体一般是由地方税务机关根据国家相关规定执行收取。
3、计算方式不同
证券经手费根据其组成部分的不同、交易金额以及证券公司的政策进行计算。印花税的计算是根据投资者的成交金额和固定的收取比例收取的。两者的收取都需要遵守相关法律和证监会的规定。
4、收取目的不同
证券经手费的收取目的是降低投资者交易过程中的交易成本，并且提高证券公司的盈利性。印花税征收的主要目的是支持国家的建设和发展。
5、收取比例不同
证券经手费：自2023年8月28日起，将A股、B股股票交易经手费从按成交金额的0.00487%双向收取下调为按成交金额的0.00341%双向收取，降幅达30%。
股票印花税：印花税的收取是固定的，不可以协商收取。其一般按照成交金额的千分之一收取，全国统一标准，并且是单向收取，也就是只在卖出股票时缴纳，买进股票不收。
经手费和印花税都是属于股票交易过程中需要缴纳的手续费之一。我们在进行股票交易的时候需要了解清楚要缴纳哪些费用，具体的如下：
1、印花税：成交金额的万分之5，单边收取，卖出收取，此为国家税收，全国统一。
2、交易佣金：不超过千分之3，最低5元起收，目前行业平均水平万分之3，双向收取，此为证券公司收取，股票手续费里面只有这一项是可以调整的。
3、经手费：成交金额的万分之0.341，双向收取，交易所收取。
4、证管费：成交金额的万分之0.2，双向收取，证监会收取。
证管费和经手费通常是合在一起的，统称规费
5、过户费：成交金额的万分之0.1，双向收取，中登公司收取。
像我们平时的佣金一般是分为净佣和全佣，所谓的全佣就是佣金里面包含了规费（部分券商含过户费），净佣则不含，如你当前的净佣是万1，那么加上规费和过户费实际上的费用是万1.641，这点需要我们在开户前了解清楚。
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