上市公司股权协议转让是一种重组方式。但是，重组并不是只有上市公司股权协议转让的这一种方式。
根据《上市公司流通股协议转让业务办理暂行规则》规定，上市公司流通股股份转让涉及下列情形，可以通过证券交易所和结算公司办理流通股协议转让手续：
1、与上市公司收购及股东权益变动相关的股份转让；
2、转让双方存在实际控制关系，或均受同一控制人所控制的；
3、外国投资者战略投资上市公司所涉及的股份转让；
4、中国证监会认定的其他情形。收回股权分置改革中的垫付股份、行政划转上市公司股份等情形规则办理。
而重组是指企业制定和控制的，将显著改变企业组织形式、经营范围或经营方式的计划实施行为。
属于重组的事项主要包括：1、出售或终止企业的部分经营业务；2、对企业的组织结构进行较大调整；3、关闭企业的部分营业场所，或将营业活动由一个国家或地区迁移到其他国家或地区。重组还包括股份分拆、合并、资本缩减（部分偿还）以及名称改变。
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