职工医保转为灵活就业主要有三个影响：
一、缴费不划入个人医保账户
在职人员缴纳职工医保时，单位缴费部分进入医保统筹账户，个人缴费部分2%全部划入个人医保账户，日常可以使用个人医保账户当中的钱看病买药。而灵活就业医保的缴纳费用全部进入医保统筹账户，个人医保账户是不进账的。
二、生育保险待遇受影响
大多数地区灵活就业医保是不享受生育保险待遇的，既无法报销产检、分娩费用，也没有生育津贴。只有个别地区的灵活就业人员缴纳医保时可以享受生育保险，可以报销费用，但是生育津贴是肯定没有的。
三、缴费压力大
在职人员的医保缴费由单位负责大头，个人仅需缴纳2%，并且会划入到个人医保账户中，用于日常买药，相当于节省一部分开支。而大部分地区的灵活就业人员医保需要缴纳10%左右，且没有个人医保账户存额，买点日常用药需要另外掏钱买。以四川省最低缴费基数4246元进行计算，在职人员缴纳医保个人每月只需支付84.92元，灵活就业人员缴纳医保则需要每月424.6元，大概涨了5倍的费用，缴费压力是比较大的。
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