新农合的报销比例没有社保报销比例高，新农合和社保都是我国基本医疗保障制度的一部分，还有一个城镇居民医保，覆盖全体城乡居民。住院的针对不同对象、筹集基金标准不同、经费来源、补偿标准不同，赔付比例也有差异。
新农合针对的承保人群一般是农村务农人员，在保费上没有职工社保或城镇职工医保的缴纳费率高，所以一般职员社保或者城镇居民医保的报销比例比新农合高。
但是无论哪一类人员，门诊、急诊大额医疗费支付的费用最高限额是两万元。一般城镇居民医疗保险报销比例较高，城镇居民医疗保险的报销比例高达85%，新农合的报销比例根据不同医院的等级报销比例在10%-80%之间。
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